过去认为“无酸不成溃疡”，所以主要治疗措施就是抑制胃酸分泌，治疗似乎变为不管哪一种胃疾都用杀菌药物，也不管该药对胃黏膜是否有刺激。
抑酸和保护黏膜要细分
胃溃疡患者的胃酸分泌可以正常或低下，主要发病机制是防御、修复功能减弱，此时的抑酸治疗并不是最主要的措施，尤其是对胃酸分泌低下者反而有害。此时应以保护胃黏膜为主要措施，如服用硫糖铝、枸橼酸铋钾、米索前列醇等。配合适当的饮食治疗，戒烟戒酒、少食辛辣。
大多数十二指肠溃疡患者的胃酸分泌是增多的，该病的主要发病机制是侵袭因素增强，因此抑酸药物不可或缺；但以保护胃黏膜为主要作用的药物对此疗效则大打折扣，如服用硫糖铝对十二指肠溃疡的治疗几乎无任何作用。
用好动力药和解痉药
胃溃疡患者的迷走神经功能正常或低下，造成胃蠕动减慢，蠕动力减弱，此时应用多潘力酮、甲氧氯普胺增加胃动力，将食物、胃酸和各种消化酶从胃内及时送出，以尽量减少对胃黏膜的侵蚀。
十二指肠溃疡患者的迷走神经功能呈亢奋状态，胃酸分泌增加，此时应用促胃肠动力药，不仅于病无益，反而使大量食物快速进入十二指肠，刺激十二指肠大量分泌胃泌素，造成胃酸大量增加，使原本单纯的十二指肠溃疡又并发胃溃疡，成了复合性溃疡，更增加了治疗难度。
如何治疗两种溃疡
当某一患者确诊为消化性溃疡后，不要急于将三联或四联疗法不加选择地应用，而应进一步细化为胃溃疡或十二指肠溃疡。对于胃酸增多者应予以质子泵抑制剂为主的三联疗法，要充分考虑到精神因素对胃酸分泌的促进作用，可适量配伍镇静药，如安定、多虑平等。
十二指肠溃疡的主要发病机制是侵袭因素的增强，所以要想提高疗效，缩短疗程，抗胆碱能药物的使用必不可少，如颠茄、山莨菪碱等。尽管有一定副作用，但药物停用后副作用即消失，不会对躯体造成大的或不可逆转的损害。
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